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关于种质资源论文范文写作 基于SSR标记构建白蜡种质资源分子身份证相关论文写作资料

主题:种质资源论文写作 时间:2024-04-03

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摘 要:以山东省林业科学研究院寿光试验站收集的46份白蜡为试验材料,对白蜡种质资源分子身份证的构建进行探究.利用SSR标记技术对白蜡试材进行区分,从150对引物中筛选出11对SSR引物对选定白蜡试材进行扩增,每个引物可以检测到3~5个基因型,平均每对引物扩增出2.52条带和2.09条多态性带,平均多态性位点百分率为82.93%.将11对引物及其检测出的等位基因依次赋值,构建了供试白蜡种质资源的分子身份证,能够达到区分各品种的目的.

关键词:白蜡;SSR;分子身份证

中图分类号:S687.1∶Q781文献标识号:A文章编号:1001-4942(2015)05-0006-05

Establishment of Molecular ID for Fraxinus

Germplasms Based on SSR Markers

Hu Chunlong1, Zhang Chen1, Liu Cuilan2,3, Li Li2,3,

Yan Liping2,3, Wu Dejun2,3, Xia Yang2,3, Xing Shiyan1, Wang Kaifang2*

(1.College of Forestry, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China; 2.Shandong Academy of Forestry,

Jinan 250014,China; 3.Shandong Provincial Key Laboratory of Forest Tree Genetic Improvement, Jinan 250014, China)

AbstractUsing 46 Fraxinus materials from the Shouguang Experimental Station of Shandong Academy of Forestry, the establishment of molecular ID for Fraxinus germplasms was studied. These Fraxinus materials were distinguished by SSR markers. Eleven pairs of primers screened from 150 pairs were used to amplify the selected Fraxinus materials. The results showed that 3~5 genotypes could be detected by each primer. The average number of bands and polymorphic bands were 2.52 and 2.09 amplified by every pair of primers. The average polymorphic loci percentage was 82.93%. After assignment of 11 pairs of primers and their alleles, the molecular IDs were established for the tested Fraxinus germplasms, which could well distinguish the varieties of Fraxinus.

Key wordsFraxinus velutina Torr; SSR; Molecular ID

白蜡(Fraxinus sp.)属双子叶植物纲,木犀科(Oleceae),木犀亚科(Oleoideae).目前发现的白蜡约有70多种,在我国已见约34种.白蜡树耐盐碱、干形出众,作为一种常见绿化树种,在我国分布广泛.由于白蜡种质资源种类繁多,品种的鉴定引起研究者广泛关注.20世纪80年代末,微卫星标记技术(SSR)的不断发展和完善为白蜡种质资源分子层面的鉴定奠定了基础.

SSR微卫星标记分布比较均匀、稳定性较高、重复性好且多态性丰富,在拟南芥等植物中的编码区、非编码区均广泛存在,为种质资源的纯度及品种真实性鉴定提供理论依据.近年来,部分学者通过SSR技术在荔枝、黑核桃等植物上取得一定进展,并成功构建了大豆、香蕉、甘蔗、梨和桃等种质资源的分子ID.然而到目前为止,SSR标记技术在白蜡上还鲜有应用.本研究利用SSR标记技术,以山东省林业科学研究院寿光试验站保存的46份白蜡为试材,运用相关软件进行分析,通过分子层面的研究,以期为探究构建白蜡种质分子身份证的方法提供理论依据,为白蜡新品种的审定、DUS测试、分子标记辅助育种等奠定理论基础.

1材料和方法

1.1试验材料

选用山东省林业科学研究院寿光试验站收集保存的46份白蜡为试材(表1).

1.2白蜡基因组DNA提取

取白蜡试材的新鲜叶片置于-50℃保存,采用改进CTAB法提取白蜡基因组DNA.

1.3DNA检测方法

将提取的白蜡基因组DNA进行琼脂糖凝胶电泳检测,经EB染色后在紫外灯下拍照,检测是否有DNA条带.利用微量分光光度计检测DNA质量,将DNA按1∶50稀释,置于-20℃保存备用.

1.4引物的合成和PCR反应

SSR引物为山东省林业科学研究院通过转录组测序开发合成的白蜡特异性引物,由上海生工生物工程股份有限公司合成.反应体系为10 μL,包含:Mg2+(25 mmol/L)0.1 μL、正反向引物(10 μmol/L)各1 μL、模板DNA(10 ng/μL)为1 μL,Taq酶(5 U/μL)5 μL,用ddH2O补足至10 μL.PCR扩增程序:94℃预变性3 min;94℃变性1 min,52℃退火1 min,72℃延伸1 min,35个循环;最后72℃延伸5 min.采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,经过固定、银染、漂洗、显影等步骤后获得相应的指纹图谱,统计数据后通过软件进行分析.

结论:关于本文可作为种质资源方面的大学硕士与本科毕业论文种质资源库包括论文开题报告范文和职称论文论文写作参考文献下载。

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